Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms