Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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