Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Prdm16A2A935 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm16A2A935 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Prdm16A2A935 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Prdm16A2A935 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm16A2A935 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Prdm16A2A935 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm16A2A935 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm16A2A935 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm16A2A935 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Prdm16A2A935 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Prdm16A2A935 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm16A2A935 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm16A2A935 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Prdm16A2A935 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm16A2A935 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Prdm16A2A935 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Prdm16A2A935 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Prdm16A2A935 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Prdm16A2A935 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm16A2A935 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Prdm16A2A935 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm16A2A935 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm16A2A935 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm16A2A935 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm16A2A935 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm16A2A935 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm16A2A935 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm16A2A935 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm16A2A935 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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