Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z309

Cib2, Calcium and integrin-binding family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib2Q9Z309 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cib2Q9Z309 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cib2Q9Z309 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms