Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hdac6Q9Z2V5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac6Q9Z2V5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
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