Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt16Q9Z2K1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt16Q9Z2K1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt16Q9Z2K1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt16Q9Z2K1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt16Q9Z2K1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt16Q9Z2K1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Krt16Q9Z2K1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt16Q9Z2K1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt16Q9Z2K1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt16Q9Z2K1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt16Q9Z2K1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt16Q9Z2K1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt16Q9Z2K1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt16Q9Z2K1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt16Q9Z2K1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt16Q9Z2K1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt16Q9Z2K1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt16Q9Z2K1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt16Q9Z2K1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt16Q9Z2K1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt16Q9Z2K1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt16Q9Z2K1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt16Q9Z2K1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt16Q9Z2K1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt16Q9Z2K1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt16Q9Z2K1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt16Q9Z2K1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt16Q9Z2K1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt16Q9Z2K1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt16Q9Z2K1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt16Q9Z2K1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt16Q9Z2K1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Krt16Q9Z2K1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt16Q9Z2K1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Krt16Q9Z2K1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms