Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z275

Rlbp1, Retinaldehyde-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rlbp1Q9Z275 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rlbp1Q9Z275 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rlbp1Q9Z275 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rlbp1Q9Z275 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rlbp1Q9Z275 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rlbp1Q9Z275 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rlbp1Q9Z275 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rlbp1Q9Z275 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rlbp1Q9Z275 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rlbp1Q9Z275 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rlbp1Q9Z275 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rlbp1Q9Z275 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rlbp1Q9Z275 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rlbp1Q9Z275 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rlbp1Q9Z275 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rlbp1Q9Z275 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rlbp1Q9Z275 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rlbp1Q9Z275 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rlbp1Q9Z275 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rlbp1Q9Z275 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rlbp1Q9Z275 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rlbp1Q9Z275 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rlbp1Q9Z275 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rlbp1Q9Z275 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rlbp1Q9Z275 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rlbp1Q9Z275 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rlbp1Q9Z275 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rlbp1Q9Z275 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rlbp1Q9Z275 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rlbp1Q9Z275 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rlbp1Q9Z275 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rlbp1Q9Z275 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rlbp1Q9Z275 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rlbp1Q9Z275 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rlbp1Q9Z275 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms