Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccne2Q9Z238 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms