Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RfxankQ9Z205 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RfxankQ9Z205 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RfxankQ9Z205 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RfxankQ9Z205 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RfxankQ9Z205 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RfxankQ9Z205 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RfxankQ9Z205 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RfxankQ9Z205 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RfxankQ9Z205 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RfxankQ9Z205 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RfxankQ9Z205 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RfxankQ9Z205 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RfxankQ9Z205 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RfxankQ9Z205 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RfxankQ9Z205 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RfxankQ9Z205 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RfxankQ9Z205 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RfxankQ9Z205 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RfxankQ9Z205 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RfxankQ9Z205 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RfxankQ9Z205 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RfxankQ9Z205 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RfxankQ9Z205 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms