Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trip6Q9Z1Y4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trip6Q9Z1Y4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms