Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ilf3Q9Z1X4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ilf3Q9Z1X4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ilf3Q9Z1X4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ilf3Q9Z1X4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ilf3Q9Z1X4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ilf3Q9Z1X4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ilf3Q9Z1X4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ilf3Q9Z1X4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ilf3Q9Z1X4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ilf3Q9Z1X4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ilf3Q9Z1X4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ilf3Q9Z1X4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ilf3Q9Z1X4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ilf3Q9Z1X4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ilf3Q9Z1X4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ilf3Q9Z1X4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ilf3Q9Z1X4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ilf3Q9Z1X4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ilf3Q9Z1X4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms