Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx39bQ9Z1N5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms