Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cacna2d3Q9Z1L5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cacna2d3Q9Z1L5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms