Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z199

Supt4h1b, Transcription elongation factor SPT4-B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt4h1bQ9Z199 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Supt4h1bQ9Z199 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Supt4h1bQ9Z199 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Supt4h1bQ9Z199 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Supt4h1bQ9Z199 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Supt4h1bQ9Z199 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Supt4h1bQ9Z199 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Supt4h1bQ9Z199 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Supt4h1bQ9Z199 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Supt4h1bQ9Z199 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Supt4h1bQ9Z199 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Supt4h1bQ9Z199 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Supt4h1bQ9Z199 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Supt4h1bQ9Z199 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Supt4h1bQ9Z199 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Supt4h1bQ9Z199 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Supt4h1bQ9Z199 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Supt4h1bQ9Z199 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Supt4h1bQ9Z199 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Supt4h1bQ9Z199 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Supt4h1bQ9Z199 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Supt4h1bQ9Z199 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Supt4h1bQ9Z199 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Supt4h1bQ9Z199 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Supt4h1bQ9Z199 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Supt4h1bQ9Z199 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Supt4h1bQ9Z199 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Supt4h1bQ9Z199 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Supt4h1bQ9Z199 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Supt4h1bQ9Z199 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Supt4h1bQ9Z199 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Supt4h1bQ9Z199 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Supt4h1bQ9Z199 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Supt4h1bQ9Z199 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Supt4h1bQ9Z199 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Supt4h1bQ9Z199 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms