Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hmg20bQ9Z104 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hmg20bQ9Z104 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms