Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Skp2Q9Z0Z3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.8 ms