Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NgfrQ9Z0W1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms