Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clip2Q9Z0H8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clip2Q9Z0H8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Clip2Q9Z0H8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Clip2Q9Z0H8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clip2Q9Z0H8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clip2Q9Z0H8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clip2Q9Z0H8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clip2Q9Z0H8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clip2Q9Z0H8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clip2Q9Z0H8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clip2Q9Z0H8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clip2Q9Z0H8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clip2Q9Z0H8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clip2Q9Z0H8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clip2Q9Z0H8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clip2Q9Z0H8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clip2Q9Z0H8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clip2Q9Z0H8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clip2Q9Z0H8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clip2Q9Z0H8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clip2Q9Z0H8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clip2Q9Z0H8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clip2Q9Z0H8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clip2Q9Z0H8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clip2Q9Z0H8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clip2Q9Z0H8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clip2Q9Z0H8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clip2Q9Z0H8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clip2Q9Z0H8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clip2Q9Z0H8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clip2Q9Z0H8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clip2Q9Z0H8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clip2Q9Z0H8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms