Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL6

Extl3, Exostosin-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl3Q9WVL6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Extl3Q9WVL6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Extl3Q9WVL6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Extl3Q9WVL6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Extl3Q9WVL6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Extl3Q9WVL6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Extl3Q9WVL6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Extl3Q9WVL6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Extl3Q9WVL6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Extl3Q9WVL6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Extl3Q9WVL6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Extl3Q9WVL6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Extl3Q9WVL6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Extl3Q9WVL6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Extl3Q9WVL6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Extl3Q9WVL6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Extl3Q9WVL6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Extl3Q9WVL6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Extl3Q9WVL6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Extl3Q9WVL6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Extl3Q9WVL6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Extl3Q9WVL6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Extl3Q9WVL6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Extl3Q9WVL6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Extl3Q9WVL6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Extl3Q9WVL6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Extl3Q9WVL6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Extl3Q9WVL6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Extl3Q9WVL6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Extl3Q9WVL6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Extl3Q9WVL6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms