Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Slit3Q9WVB4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slit3Q9WVB4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slit3Q9WVB4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slit3Q9WVB4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slit3Q9WVB4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slit3Q9WVB4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slit3Q9WVB4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slit3Q9WVB4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slit3Q9WVB4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slit3Q9WVB4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slit3Q9WVB4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slit3Q9WVB4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slit3Q9WVB4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slit3Q9WVB4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slit3Q9WVB4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slit3Q9WVB4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slit3Q9WVB4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slit3Q9WVB4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slit3Q9WVB4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slit3Q9WVB4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slit3Q9WVB4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slit3Q9WVB4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slit3Q9WVB4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slit3Q9WVB4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slit3Q9WVB4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slit3Q9WVB4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slit3Q9WVB4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slit3Q9WVB4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slit3Q9WVB4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms