Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stxbp4Q9WV89 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stxbp4Q9WV89 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stxbp4Q9WV89 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stxbp4Q9WV89 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stxbp4Q9WV89 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stxbp4Q9WV89 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stxbp4Q9WV89 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stxbp4Q9WV89 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stxbp4Q9WV89 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stxbp4Q9WV89 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stxbp4Q9WV89 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stxbp4Q9WV89 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stxbp4Q9WV89 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stxbp4Q9WV89 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stxbp4Q9WV89 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stxbp4Q9WV89 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stxbp4Q9WV89 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stxbp4Q9WV89 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Stxbp4Q9WV89 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stxbp4Q9WV89 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stxbp4Q9WV89 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stxbp4Q9WV89 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stxbp4Q9WV89 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stxbp4Q9WV89 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stxbp4Q9WV89 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stxbp4Q9WV89 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stxbp4Q9WV89 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stxbp4Q9WV89 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stxbp4Q9WV89 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stxbp4Q9WV89 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stxbp4Q9WV89 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stxbp4Q9WV89 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stxbp4Q9WV89 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stxbp4Q9WV89 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stxbp4Q9WV89 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stxbp4Q9WV89 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms