Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms