Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srd5a3Q9WUP4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srd5a3Q9WUP4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srd5a3Q9WUP4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srd5a3Q9WUP4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srd5a3Q9WUP4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srd5a3Q9WUP4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srd5a3Q9WUP4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srd5a3Q9WUP4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srd5a3Q9WUP4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srd5a3Q9WUP4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srd5a3Q9WUP4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Srd5a3Q9WUP4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srd5a3Q9WUP4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srd5a3Q9WUP4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srd5a3Q9WUP4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srd5a3Q9WUP4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srd5a3Q9WUP4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srd5a3Q9WUP4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srd5a3Q9WUP4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srd5a3Q9WUP4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srd5a3Q9WUP4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srd5a3Q9WUP4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srd5a3Q9WUP4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Srd5a3Q9WUP4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srd5a3Q9WUP4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srd5a3Q9WUP4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srd5a3Q9WUP4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srd5a3Q9WUP4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srd5a3Q9WUP4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srd5a3Q9WUP4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Srd5a3Q9WUP4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Srd5a3Q9WUP4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Srd5a3Q9WUP4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Srd5a3Q9WUP4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Srd5a3Q9WUP4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srd5a3Q9WUP4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srd5a3Q9WUP4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srd5a3Q9WUP4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srd5a3Q9WUP4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srd5a3Q9WUP4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srd5a3Q9WUP4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srd5a3Q9WUP4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srd5a3Q9WUP4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms