Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUI0

Mixl1, Homeobox protein MIXL1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mixl1Q9WUI0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mixl1Q9WUI0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.3 ms