Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PrkraQ9WTX2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrkraQ9WTX2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms