Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fam50bQ9WTJ8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fam50bQ9WTJ8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fam50bQ9WTJ8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fam50bQ9WTJ8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fam50bQ9WTJ8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fam50bQ9WTJ8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fam50bQ9WTJ8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fam50bQ9WTJ8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fam50bQ9WTJ8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fam50bQ9WTJ8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fam50bQ9WTJ8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fam50bQ9WTJ8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fam50bQ9WTJ8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fam50bQ9WTJ8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fam50bQ9WTJ8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fam50bQ9WTJ8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fam50bQ9WTJ8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms