Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PplQ9R269 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PplQ9R269 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PplQ9R269 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PplQ9R269 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PplQ9R269 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PplQ9R269 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PplQ9R269 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PplQ9R269 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PplQ9R269 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PplQ9R269 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PplQ9R269 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PplQ9R269 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PplQ9R269 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PplQ9R269 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PplQ9R269 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PplQ9R269 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PplQ9R269 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PplQ9R269 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PplQ9R269 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PplQ9R269 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PplQ9R269 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PplQ9R269 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PplQ9R269 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PplQ9R269 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PplQ9R269 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PplQ9R269 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PplQ9R269 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PplQ9R269 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PplQ9R269 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PplQ9R269 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PplQ9R269 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PplQ9R269 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PplQ9R269 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PplQ9R269 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PplQ9R269 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PplQ9R269 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PplQ9R269 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PplQ9R269 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PplQ9R269 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PplQ9R269 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PplQ9R269 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PplQ9R269 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PplQ9R269 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PplQ9R269 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PplQ9R269 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PplQ9R269 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PplQ9R269 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PplQ9R269 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PplQ9R269 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PplQ9R269 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PplQ9R269 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PplQ9R269 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PplQ9R269 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PplQ9R269 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PplQ9R269 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PplQ9R269 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PplQ9R269 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PplQ9R269 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PplQ9R269 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PplQ9R269 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PplQ9R269 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms