Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sorbs3Q9R1Z8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms