Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S7

Abcc6, Multidrug resistance-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc6Q9R1S7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Abcc6Q9R1S7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Abcc6Q9R1S7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Abcc6Q9R1S7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Abcc6Q9R1S7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Abcc6Q9R1S7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Abcc6Q9R1S7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Abcc6Q9R1S7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Abcc6Q9R1S7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Abcc6Q9R1S7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Abcc6Q9R1S7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Abcc6Q9R1S7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Abcc6Q9R1S7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Abcc6Q9R1S7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Abcc6Q9R1S7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Abcc6Q9R1S7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Abcc6Q9R1S7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Abcc6Q9R1S7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Abcc6Q9R1S7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Abcc6Q9R1S7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Abcc6Q9R1S7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc6Q9R1S7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc6Q9R1S7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc6Q9R1S7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc6Q9R1S7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc6Q9R1S7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc6Q9R1S7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc6Q9R1S7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc6Q9R1S7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc6Q9R1S7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc6Q9R1S7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc6Q9R1S7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc6Q9R1S7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc6Q9R1S7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Abcc6Q9R1S7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Abcc6Q9R1S7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Abcc6Q9R1S7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Abcc6Q9R1S7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Abcc6Q9R1S7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Abcc6Q9R1S7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Abcc6Q9R1S7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Abcc6Q9R1S7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Abcc6Q9R1S7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Abcc6Q9R1S7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Abcc6Q9R1S7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Abcc6Q9R1S7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Abcc6Q9R1S7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Abcc6Q9R1S7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms