Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim3Q9R1R2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim3Q9R1R2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim3Q9R1R2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim3Q9R1R2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim3Q9R1R2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim3Q9R1R2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim3Q9R1R2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim3Q9R1R2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim3Q9R1R2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms