Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gpc6Q9R087 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gpc6Q9R087 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gpc6Q9R087 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gpc6Q9R087 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gpc6Q9R087 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gpc6Q9R087 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gpc6Q9R087 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gpc6Q9R087 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gpc6Q9R087 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gpc6Q9R087 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gpc6Q9R087 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gpc6Q9R087 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gpc6Q9R087 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gpc6Q9R087 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gpc6Q9R087 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gpc6Q9R087 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpc6Q9R087 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpc6Q9R087 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpc6Q9R087 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpc6Q9R087 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpc6Q9R087 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpc6Q9R087 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpc6Q9R087 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Gpc6Q9R087 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Gpc6Q9R087 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Gpc6Q9R087 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc6Q9R087 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpc6Q9R087 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpc6Q9R087 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpc6Q9R087 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpc6Q9R087 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpc6Q9R087 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpc6Q9R087 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpc6Q9R087 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpc6Q9R087 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpc6Q9R087 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpc6Q9R087 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpc6Q9R087 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpc6Q9R087 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpc6Q9R087 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpc6Q9R087 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpc6Q9R087 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpc6Q9R087 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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