Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms