Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ripk3Q9QZL0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ripk3Q9QZL0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms