Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phtf1Q9QZ09 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms