Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tomm40Q9QYA2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tomm40Q9QYA2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tomm40Q9QYA2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tomm40Q9QYA2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tomm40Q9QYA2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tomm40Q9QYA2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm40Q9QYA2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm40Q9QYA2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm40Q9QYA2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm40Q9QYA2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm40Q9QYA2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm40Q9QYA2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm40Q9QYA2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm40Q9QYA2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm40Q9QYA2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm40Q9QYA2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm40Q9QYA2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm40Q9QYA2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm40Q9QYA2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tomm40Q9QYA2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tomm40Q9QYA2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms