Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VapbQ9QY76 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VapbQ9QY76 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VapbQ9QY76 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VapbQ9QY76 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VapbQ9QY76 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VapbQ9QY76 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VapbQ9QY76 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VapbQ9QY76 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VapbQ9QY76 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
VapbQ9QY76 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms