Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Nr2e3Q9QXZ7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms