Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nufip1Q9QXX8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms