Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms