Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpsf3Q9QXK7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpsf3Q9QXK7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpsf3Q9QXK7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpsf3Q9QXK7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpsf3Q9QXK7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpsf3Q9QXK7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpsf3Q9QXK7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpsf3Q9QXK7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpsf3Q9QXK7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpsf3Q9QXK7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpsf3Q9QXK7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpsf3Q9QXK7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpsf3Q9QXK7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpsf3Q9QXK7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpsf3Q9QXK7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cpsf3Q9QXK7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cpsf3Q9QXK7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cpsf3Q9QXK7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cpsf3Q9QXK7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpsf3Q9QXK7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpsf3Q9QXK7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpsf3Q9QXK7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpsf3Q9QXK7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cpsf3Q9QXK7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpsf3Q9QXK7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpsf3Q9QXK7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms