Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim44Q9QXA7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim44Q9QXA7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms