Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Homer2Q9QWW1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Homer2Q9QWW1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms