Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mid2Q9QUS6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms