Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms