Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sfmbt1Q9JMD1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms