Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc42ep4Q9JM96 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc42ep4Q9JM96 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc42ep4Q9JM96 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc42ep4Q9JM96 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc42ep4Q9JM96 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc42ep4Q9JM96 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc42ep4Q9JM96 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc42ep4Q9JM96 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc42ep4Q9JM96 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc42ep4Q9JM96 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc42ep4Q9JM96 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc42ep4Q9JM96 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc42ep4Q9JM96 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc42ep4Q9JM96 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc42ep4Q9JM96 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdc42ep4Q9JM96 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdc42ep4Q9JM96 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdc42ep4Q9JM96 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdc42ep4Q9JM96 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdc42ep4Q9JM96 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdc42ep4Q9JM96 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdc42ep4Q9JM96 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdc42ep4Q9JM96 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdc42ep4Q9JM96 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdc42ep4Q9JM96 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdc42ep4Q9JM96 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdc42ep4Q9JM96 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdc42ep4Q9JM96 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cdc42ep4Q9JM96 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc42ep4Q9JM96 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms