Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SrfQ9JM73 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrfQ9JM73 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrfQ9JM73 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrfQ9JM73 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrfQ9JM73 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SrfQ9JM73 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SrfQ9JM73 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrfQ9JM73 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrfQ9JM73 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrfQ9JM73 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrfQ9JM73 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrfQ9JM73 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrfQ9JM73 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrfQ9JM73 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrfQ9JM73 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrfQ9JM73 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrfQ9JM73 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrfQ9JM73 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrfQ9JM73 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrfQ9JM73 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrfQ9JM73 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrfQ9JM73 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrfQ9JM73 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrfQ9JM73 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SrfQ9JM73 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SrfQ9JM73 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrfQ9JM73 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrfQ9JM73 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrfQ9JM73 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrfQ9JM73 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms