Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms