Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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CubnQ9JLB4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CubnQ9JLB4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CubnQ9JLB4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CubnQ9JLB4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CubnQ9JLB4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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CubnQ9JLB4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CubnQ9JLB4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CubnQ9JLB4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CubnQ9JLB4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CubnQ9JLB4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CubnQ9JLB4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CubnQ9JLB4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CubnQ9JLB4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CubnQ9JLB4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CubnQ9JLB4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CubnQ9JLB4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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CubnQ9JLB4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CubnQ9JLB4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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CubnQ9JLB4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CubnQ9JLB4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CubnQ9JLB4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CubnQ9JLB4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CubnQ9JLB4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CubnQ9JLB4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CubnQ9JLB4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CubnQ9JLB4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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CubnQ9JLB4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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CubnQ9JLB4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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CubnQ9JLB4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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CubnQ9JLB4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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CubnQ9JLB4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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CubnQ9JLB4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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CubnQ9JLB4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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CubnQ9JLB4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms