Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfx5Q9JL61 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfx5Q9JL61 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfx5Q9JL61 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx5Q9JL61 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx5Q9JL61 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx5Q9JL61 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx5Q9JL61 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx5Q9JL61 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx5Q9JL61 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx5Q9JL61 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx5Q9JL61 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx5Q9JL61 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx5Q9JL61 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx5Q9JL61 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx5Q9JL61 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx5Q9JL61 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx5Q9JL61 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx5Q9JL61 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx5Q9JL61 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx5Q9JL61 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx5Q9JL61 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx5Q9JL61 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx5Q9JL61 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx5Q9JL61 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx5Q9JL61 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx5Q9JL61 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx5Q9JL61 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx5Q9JL61 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx5Q9JL61 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx5Q9JL61 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx5Q9JL61 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx5Q9JL61 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfx5Q9JL61 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms